Кафедра физической культуры и начальной военной подготовки является одной из основных кафедр факультета, которая готовит спортсменов по выбранным видам спорта, преподавателей физического воспитания и начальной военной подготовки, а также новое поколение преподавателей, конкурентоспособных, современных, обеспечивающих качественное образование и осознанное воспитание на высоком уровне.

Кафедра была основана в 1982 году под названием «Спортивные дисциплины» с целью предоставления специального образования студентам. Заведующим кафедрой был назначен А. Амиров. В преподавательский состав кафедры входили кандидат физических наук, профессор Н. Мамбетов, доктор физических наук, профессор Т. Ботагариев, и выпускник Казахского института физической культуры А. С. Аралбаев. Кафедра ежегодно пополнялась молодыми специалистами, окончившими специализированные учебные заведения. В частности, выпускниками Казахского института физической культуры Е. И. Бекбосыновом (бокс), А. Н. Шагировым (волейбол), А. Аизаковым (гимнастика), выпускником Краснодарского института физической культуры Е. К. Толегеновым (баскетбол). П.П. Глонин (баскетбол), выпускник факультета физической культуры и спорта Грозного университета, С. Самигуллин, М.В. Шинкер (легкая атлетика), выпускники Карагандинского института физической культуры, а также Г.М. Утебалиева, В. Абакумов, В. Шевцов, С. Куцеволов, Р.А. Канатбаева, с отличием окончившие первый курс физического воспитания Гурьевского педагогического института, были оставлены на должности преподавателей кафедры.

Кафедра укомплектована научно-педагогическим персоналом и высококвалифицированными специалистами. В преподавательский состав входят профессора, доценты, кандидаты наук, тренеры международного уровня, мастера спорта, мастера спорта Республики Казахстан. С 2020 года кафедру возглавляет кандидат педагогических наук, профессор А.С. Аралбаев.

В настоящее время кафедра реализует образовательные программы на уровне бакалавриата: 6B01401 – Учитель физической культуры и тренер по выбранному виду спорта, 6B01402 – Учитель начальной военной и технологической, физической подготовки,  6B01407 – Физическая культура и спорт IP.

Кафедра физической культуры и начальной военной подготовки за свою 42-летнюю историю развития внесла огромный вклад в развитие и совершенствование спорта в университете, регионе и республике, а также в образовательный процесс.

Преподавательский состав кафедры систематически занимается научной деятельностью. Основные направления их научной работы: укрепление здоровья людей с ограниченными возможностями, проведение спортивных игр в общеобразовательных школах на уровне новых инновационных технологий, повышение взаимодействия между физическим воспитанием довоенной молодежи и военно-патриотическим воспитанием, использование инновационных технологий на уроках школьной физической культуры, подготовка квалифицированных специалистов в области физической культуры и начальной военной подготовки.

В целях подготовки квалифицированных научных специалистов кафедра установила тесные партнерские отношения с университетами Кыргызстана, России, Турции, а также с высшими учебными заведениями в городах Алматы, Караганда, Туркестан, Актау, Шымкент, Уральск, Актюбе и Национальным научно-практическим центром физического воспитания.

В рамках сотрудничества со специализированными детскими и юношескими школами регионального олимпийского заповедника были открыты филиалы кафедры, которые эффективно организуют профессиональную практику, научно-исследовательскую работу учащихся и повышают их спортивные навыки.

Образовательная работа отдела направлена ​​на популяризацию национальной культуры, духа, искусства, спорта, национальных ценностей, почитание родного языка и воспитание сознательного, честного поколения. Традиционно проводятся учебные часы, посвященные национальным праздникам страны, встречи со спортивными ветеранами и выдающимися спортсменами. Уроки и знания, которые эти мероприятия дают учащимся и молодежи, имеют огромную ценность.

В настоящее время по ОП обучаются 20 мастеров спорта международного уровня Республики Казахстан, более 35 мастеров спорта  Республики Казахстан и около 200 кандидатов в мастера спорта Республики Казахстан. Они неустанно трудятся, защищая честь нашей страны и университета и повышая его статус в региональных, республиканских и международных спортивных соревнованиях.

С 1992 по 2025 год студенты-спортсмены по ОП неоднократно становились лучшими на соревнованиях и прославляли страну. В частности, среди них: Б. Темиров, пятикратный чемпион СССР, мастер спорта международного класса, участник Олимпийских игр 1992 года в Барселоне; гребцы, многократные победители чемпионата Казахстана, участники Олимпийских игр 1996 года в Атланте; мастера спорта международного класса С. Сергеев, А. Сафарян, И. Гадиатуллин, дзюдоист, победитель чемпионата Казахстана, победитель Кубка мира, чемпион мира среди молодежи по самбо. Р. Ибрагимов, участник Олимпийских игр 2008 года в Пекине, мастер спорта международного класса, тхэквондист, победитель чемпионата Казахстана, победитель Азиатских игр, бронзовый призёр Олимпийских игр 2008 года в Пекине, бронзовый призёр чемпионата мира, мастер спорта международного класса; А. Чилманов, таеквондист, чемпион Универсиады среди студентов Казахстана, золотой медалист Летней Всемирной студенческой Универсиады, мастер спорта; Г. Айтмуханбетова, кикбоксер, победитель чемпионата Казахстана, чемпион мира, мастер спорта международного класса; М. Айткалиев и др. Университетская команда участвовала в Летней Универсиаде среди студентов высших учебных заведений Казахстана, которая проводится каждые два года, и завоевала призы в нескольких видах спорта: лёгкая атлетика, самбо, дзюдо, вольная борьба, греко-римская борьба, футзал, баскетбол. Волейбол, настольный теннис, тхэквондо, кратэ-до, бокс. На XII летней Универсиаде 2023 года в Актау Атырауский университет занял 7-е место в общем командном зачете, завоевав 8 золотых, 4 серебряных и 19 бронзовых медалей.

Университетская команда участвовала в Спортивной Универсиаде, проходившей по программе Ассоциации университетов прикаспийских государств с участием студентов из университетов России, Азербайджана, Туркменистана, Исламской Республики Иран и Казахстана в 2000 году в Астрахани (АГТУ, Россия), в 2002 году в Атырау (АИНГ, Казахстан), в 2004 году в Реште (Горган, Иран), в 2010 году в Махачкале (Россия), в 2018 году в Атырау (АУ им. Х. Досмухамедова, Казахстан), и отличилась победами в легкой атлетике, вольной борьбе, самбо, дзюдо, тхэквондо, баскетболе, футболе и шахматах. В 2018 году наша команда заняла 1-е место в общем командном зачете V Универсиады, организованной Атырауским университетом.

В 2024 году в Астрахани (РФ) прошла VI Универсиада среди студентов университетов прикаспийских государств под названием «Каспийские игры» с участием более 600 спортсменов из 14 университетов пяти стран в десяти видах спорта (самбо, легкая атлетика, шахматы, шашки, волейбол, баскетбол, футзал, плавание, футбол, баскетбол). По результатам соревнований Атырауский университет им. Х. Досмухамедова занял 1-е место в командном зачете в видах спорта «Баскетбол», «Фиджиталь-баскетбол», «Самбо», «Шахматы», «Шашки», «Футзал», 2-е место в «Легкой атлетике», «Фиджиталь-футболе» и «Волейболе», а в общем командном зачете занял 1-е место среди 14 университетов и был награжден специальным кубком «Каспийских игр».

В 2025 году на базе «Международного университета туризма и гостеприимства» в городе Туркестане прошла «XIII Летняя Универсиада» среди студентов высших и (или) аспирантских учебных заведений Республики Казахстан, утвержденная приказом Министра науки и высшего образования Республики Казахстан № 88 от 28 февраля 2025 года. Среди 79 высших учебных заведений студенты-спортсмены Универсиады добились больших успехов на «XIII Летней Универсиаде».

По итогам 13-й летней Универсиады команда завоевала 5 золотых, 4 серебряных и 17 бронзовых медалей, заняв 11-е место в общем командном зачете университета. Мужская баскетбольная команда выиграла Универсиаду в четвертый раз подряд.

Несмотря на сложность командных игр, мужская футбольная команда показала высокий уровень игры и заняла 3-е место на республиканском уровне. Эта победа стала прекрасным подарком к 85-летию нашего университета.

Кафедра физической культуры и начальной военной подготовки вносит значительный вклад в подготовку конкурентоспособных специалистов, обладающих теоретическими и практическими знаниями, научно-исследовательской квалификацией в области физической культуры и спорта, начальной военной подготовки.